Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm21818J3KMS6 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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