Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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