Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms