Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Ccdc47Q9D024 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Ccdc47Q9D024 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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