Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms