Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms