Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc28aQ8CEI3 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms