Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm44317-201ENSMUST00000204314 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Zfp354a-203ENSMUST00000109119 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms