Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Dync1i2-203ENSMUST00000112136 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16299-201ENSMUST00000162724 2766 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gdi2-201ENSMUST00000059515 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Ighv3-8-201ENSMUST00000103483 394 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Tubd1-202ENSMUST00000069503 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl4-201ENSMUST00000086545 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15477-202ENSMUST00000143945 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf185-202ENSMUST00000077078 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Etos1-201ENSMUST00000057134 2015 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms