Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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