Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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