Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Npy2r-204ENSMUST00000182831 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Exoc1-203ENSMUST00000113493 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Mlip-210ENSMUST00000184322 2668 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 AC160340.1-201ENSMUST00000222952 3964 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Ccdc36-201ENSMUST00000076592 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm37069-201ENSMUST00000192742 4142 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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Rpusd2Q149F1 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Srp54b-201ENSMUST00000164243 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Nudt13-201ENSMUST00000022343 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpusd2Q149F1 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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