Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Ttc39dQ0VF76 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Ttc39dQ0VF76 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Ttc39dQ0VF76 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Ttc39dQ0VF76 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ttc39dQ0VF76 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ttc39dQ0VF76 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ttc39dQ0VF76 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ttc39dQ0VF76 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms