Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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PtprmP28828 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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PtprmP28828 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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PtprmP28828 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprmP28828 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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