Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zfp82-207ENSMUST00000183190 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC151982.1-201ENSMUST00000223546 464 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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