Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TtrP07309 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms