Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms