Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Ccdc47Q9D024 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
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