Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Use1Q9CQ56 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms