Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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