Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Actn1Q7TPR4 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms