Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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