Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Magi2-215ENSMUST00000208219 3266 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
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