Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Trim71Q1PSW8 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms