Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NcanP55066 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NcanP55066 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NcanP55066 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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