Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms