Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp4P35123 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp4P35123 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp4P35123 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp4P35123 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp4P35123 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Usp4P35123 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Usp4P35123 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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