Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RxrbP28704 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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