Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ighv5-6-201ENSMUST00000103446 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Hoxd9P28357 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gpr55-201ENSMUST00000086975 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Olfr1347-202ENSMUST00000207339 1737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd9P28357 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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