Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TtrP07309 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms