Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC156037.2-201ENSMUST00000221284 112 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC166341.6-201ENSMUST00000221528 105 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 AC153663.1-201ENSMUST00000222165 120 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 CT030157.1-201ENSMUST00000222355 148 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 AC150661.2-201ENSMUST00000222418 105 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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Rabgef1Q9JM13 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm14089-201ENSMUST00000130025 318 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rabgef1Q9JM13 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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