Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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Exo5Q9CXP9 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Exo5Q9CXP9 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms