Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms