Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hecw1Q8K4P8 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms