Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Pcsk9Q80W65 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pcsk9Q80W65 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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