Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NischQ80TM9 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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