Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hoxd13P70217 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hoxd13P70217 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Hoxd13P70217 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Hoxd13P70217 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Hoxd13P70217 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Hoxd13P70217 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd13P70217 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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