Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpl28P41105 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms