Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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