Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PrkcdP28867 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms