Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PtprmP28828 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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