Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 AC122372.1-201ENSMUST00000215344 280 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Sptan1P16546 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms