Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm21818J3KMS6 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms