Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
H2-M1F7CXU4 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms