Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usf3B2RUQ2 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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