Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms