Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Rnf6Q9DBU5 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Rnf6Q9DBU5 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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