Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Zfp84-201ENSMUST00000032802 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Trcg1-201ENSMUST00000093837 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Mbnl3-201ENSMUST00000041495 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms