Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Snx8Q8CFD4 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Snx8Q8CFD4 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms