Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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